O Projeto de Ligação Lisboa-Algarve incluiu a ligação desde Pinhal Novo até Faro, para além do itinerário dos Granéis e do Troço Tunes/Lagos da Linha do Algarve.

Na ligação de Lisboa ao Algarve, o principal objetivo foi a modernização e a eletrificação do itinerário de modo a reduzir o tempo de percurso para inferior a três horas entre Lisboa e Faro para comboios pendulares, bem como o aumento da segurança e fiabilidade do sistema ferroviário e a melhoria das acessibilidades.